2009年4月14日 星期二

[Just] a preliminary molecular phylogeny of Corydoras

只是我們亂玩的小結果, 用了333隻鼠魚樣本的mtDNA序列(但我們目前實際有659隻泡在酒精裏的鼠魚樣本), 然後只是使用最簡單的tree reconstruction的方法得到這棵樹, 結果顯示Corydoras根本不是一個單系群, 這樣的結果基本上與Marcelo Britto於2003年以及Kioko et al. (2004)所發表的文章類似, 然而因為我們使用了台灣市面上已流通過絕大多數的種類, 也就是我們的taxon sampling是近乎完整的, 所以我們也得到另一種結果, 無論是Brochis, ScleromystaxAspidoras都內嵌在Corydoras之中. 所謂的"狐貍吻"型鼠魚, 也就是所謂的acutus-group, 的確形成一個單系群, 但是其它非狐貍吻型的鼠魚則不是一個單系群. 過去有學者認為同樣斑紋的鼠魚具有長短吻只是因為兩種魚的祖先在棲地利用上產生的分化, 但我們的初步結果並不支持這樣的觀點. 所有具有相似斑紋且共棲的鼠魚(如C. guapore, C. caudimaculatus)通通演化自不同的祖先, 這樣的初步結果支持共棲鼠魚之間的相似性很可能是一種穆氏擬態. 接下來我們會進行的工作就是確認一些可能被錯誤鑑定的樣本, 並增加某些類群的取樣(例如C. "Resex"的長吻型).

ps. 此玩票性研究工作由我們負責樣本與文獻收集, 資訊研讀, 分析策略與論文撰寫, 師大生科系林思民老師(及其爪牙)負責DNA抽取, 定序與初步分析工作, 中部某國立大學icenvoy大大負責全台(死)鼠魚情報網, 樣本鑑定與整理. 研究結果與任何國科會計畫都沒有關係. 魚隻主要由石頭, 台族, 華洋, APT, 台中澤苑與高雄萬沃所提供.